En dag våkner Kitty, fantasi-jenta som Anne Frank skrev til i dagboka, i Anne Franks hus i Amsterdam. Da hun leser den berømte boka vekkes minnene til live, men Anne er forsvunnet. Kitty er sikker på at Anne også er der ute et sted, og legger ut på en reise for å finne henne. Det blir en reise både i tid og rom for å gjenforenes med sin beste og eneste venn. «Hvor er Anne Frank» er en moderne nytolkning av Anne Franks dagbok, laget av den Oscar-nominerte regissøren av «Vals med Bashir» (2008), Ari Folman.