På en morgen full av gode gjerninger og superhelting, blir Spider-Man avbrutt av The Fantastic Four og Namor. Den store undervannsbyen Atlantis har forsvunnet, og heltene trenger Spider-Mans hjelp for å finne den igjen! Selv om Spider-Man er usikker på om evnene hans er nok til å finne byen, aksepterer han oppdraget og håper at han ikke skuffer heltene sine. Men da oppdraget bringer ham til Kvanteuniverset, innser han at det er mer enn en by som har forsvunnet, og at han kanskje vil trenge mer enn bare superkrefter for å redde dagen! Advarsel til lesere: På reisen gjennom Kvanteuniverset må du kanskje snu boken din sidelengs, opp ned og tilbake igjen. Du må følge instruksjonene for å holde følge med Spider-Man!