«Snake Eyes» er den tredje filmen i serien som er basert på G. I. Joe-franchisen. Her kommer G.I. Joe-helten Snake Eyes til liv i et actionfylt og nervepirrende eventyr. Snake Eyes blir invitert til Japan etter å ha reddet livet til arvingen Storm Shadow i en gammel japansk klan, kalt Arashikage. Her tas han imot som en av deres egne, og slutter seg til kampen mot terrorgruppen Cobra. I denne kampen utsettes han for maksimalt press, og utvikler seg til å bli den ultimate krigeren.
